2025顶刊文献速递 | 单细胞转录组系列(11月)-技术前沿-资讯-生物在线

2025顶刊文献速递 | 单细胞转录组系列(11月)

作者:上海伯豪生物技术有限公司 2025-12-08T00:00 (访问量:981)

为帮忙大家更快了解最新科研进展,掌握科研热点,扩展科研思路,伯豪生物特此推出最新顶刊文献速递系列推文。本期是2025年11月最新顶刊发表的单细胞转录组相关文献集萃!

顶刊文献一:STTT丨晚期胰腺癌中NK细胞疗法联合吉西他滨和S-1的动态转录免疫景观

文章标题:Dynamic transcriptional immune landscape in response to NK-cell therapy combined with gemcitabine plus S-1 in advanced pancreatic cancer: a phase 1b/2 trial

期刊:Signal Transduct Target Ther(IF:52.7)

文章摘要:该研究为评估异体NK细胞疗法联合吉西他滨和S-1作为晚期胰腺癌一线治疗的安全性和有效性,对 24 名患者施用 1×10、9 至 8×10、9 个 NK 细胞耐受良好,无移植物抗宿主病或剂量限制性毒性。在 19 例可评估患者中,客观反应率为 31.6%,疾病控制率为 73.7%。中位无进展生存期为 6.6 个月,总体生存期为 10.8 个月。对 19 个配对血样进行进一步纵向单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)检测显示,反应者中某些 NK 细胞亚群和T细胞亚群比例增加,表现为促炎和效应分子表达增加。对反应者的整体T细胞受体(TCR)Vβ序列测序显示了潜在的T细胞克隆扩增,表现为更大且过度扩张的克隆型数量增加。总之,该研究通过1b/2期临床试验表明,联合疗法耐受性良好,显示出初步疗效,并发现应答者中特定NK细胞和T细胞亚群比例增加,为NK细胞治疗的免疫机制提供了新见解。

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顶刊文献二:Nature丨小鼠视觉皮层发育中细胞类型的持续多样化

文章标题:Continuous cell-type diversification in mouse visual cortex development

期刊:Nature(IF:48.5)

文章摘要:该研究通过单细胞RNA测序和单核多组学测序技术,对胚胎11.5天至出生后56天的小鼠视觉皮层进行了密集采样,获得了568,654个高质量单细胞转录组和200,061个高质量细胞核数据。借助先进的计算生物学方法,重构了兴奋性神经元、抑制性神经元和非神经元细胞的完整发育轨迹图谱,精准定位了不同细胞类型出现的关键时间节点和分子特征。研究首次系统揭示了从胚胎期到成年期视觉皮层细胞类型持续多样化的动态过程及分子调控机制。

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顶刊文献三:Nature丨首次从临床样本分离高效抗癌CD8+T细胞簇

文章标题:Tumour-reactive heterotypic CD8 T cell clusters from clinical samples

期刊:Nature(IF:48.5)

文章摘要:近年来,免疫治疗已成为对抗癌症的重要手段,但其疗效仍因人而异。越来越多的证据表明,肿瘤微环境中CD8+ T细胞与癌细胞的物理接近程度,直接影响免疫治疗的效果。然而,这些细胞是否以能够从患者样本中直接分离的、有功能的簇形式存在,此前一直不清楚。该研究成功从21例人类黑色素瘤转移瘤临床样本中,分离出了一种由CD8+ T细胞与一个或多个肿瘤细胞及/或抗原呈递细胞紧密结合形成的“异型细胞簇”。单细胞测序分析显示,这些簇中的T细胞富含肿瘤反应性和耗竭相关基因特征,具有更高的TCR克隆性。体外实验证明,从这些簇中扩增出的T细胞,对自体黑色素瘤的杀伤活性平均提高了九倍,并伴有细胞因子产量的增加。将这类T细胞过继移植到小鼠体内后,它们能更有效地控制患者来源的肿瘤生长。研究表明,这些通常被流式细胞术单细胞圈门排除在外的异型T细胞簇,是解码功能性肿瘤-免疫细胞互作的宝贵资源,也具有巨大的治疗探索潜力。

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顶刊文献四:Nat Immunol丨单细胞多组学揭示花生过敏口服免疫疗法诱导T细胞持续无应答的机制

文章标题:Peanut allergy oral immunotherapy drives single-cell multi-omic changes in peanut-reactive T cells associated with sustained unresponsiveness

期刊:Nat Immunol(IF:27.6)

文章摘要:当前,花生口服免疫疗法(OIT)是美国食品药品监督管理局批准的唯一治疗方法,但其在停药后诱导的持续无应答(SU)成功率仍不理想。以 “花生口服免疫疗法:安全性、有效性与机制探索”(POISED)二期随机对照试验为基础,选取31名参与者(包括23名接受OIT治疗的患者、8名安慰剂对照组患者,以及5名无花生过敏的健康对照者)的外周血单个核细胞,采用 BD Rhapsody 单细胞平台,整合单细胞RNA测序、蛋白质表达分析及T细胞受体(TCR)库测序技术,对花生反应性(pr)CD4+T 细胞进行了全方位解析。这项研究不仅描绘了花生特异性CD4+T细胞在OIT过程中的动态变化图谱,更揭示了与SU密切相关的关键免疫特征,为优化过敏原特异性免疫疗法策略奠定基础。

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顶刊文献五Immunity丨髓系细胞介导晚期肾细胞癌中干扰素驱动的免疫治疗抵抗

文章标题:Myeloid cells mediate interferon-driven resistance to immunotherapy in advanced renal cell carcinoma

期刊:Immunity(IF:26.3)

文章摘要:为阐明肾细胞癌(RCC)免疫检查点阻断(ICB)耐药机制,研究人员通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)和推断建模,揭示了髓系细胞(而非肿瘤细胞)的IFNγ信号传导是导致抗PD-1/抗VEGF联合治疗原发性耐药的关键因素。研究发现IFNγ极化的巨噬细胞高表达抑制性配体,并能在体外抑制T细胞对RCC肿瘤细胞的杀伤,这表明髓系细胞是RCC中IFN驱动的免疫治疗抵抗的介质。

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顶刊文献六:Immunity丨IL-9信号增强CAR-T细胞治疗实体瘤效果

文章标题:IL-9 signaling redirects CAR T cell fate toward CD8+memory and CD4+ cycling states, enhancing antitumor efficacy

期刊:Immunity(IF:26.3)

文章摘要:嵌合抗原受体(CAR)T细胞疗法,在血液类癌症中取得了显著效果,但对于占据癌症大多数的实体瘤,由于受到实体瘤的免疫抑制性微环境的限制,其治疗效果仍差强人意。该研究发现通过共表达IL-9受体,赋予CAR T细胞异位白介素(IL)-9信号通路,能重塑抗原应激下的CAR T细胞命运,以增强抗肿瘤疗效。在临床前实体肿瘤模型中,IL-9信号传递的 CAR T 细胞表现出增强的扩增、持续性和肿瘤浸润性,使得在显著较低剂量下优于传统产品实现了更优异的肿瘤控制。单细胞RNA测序数据的轨迹和RNA速度分析显示,IL-9信号在抗原应激下改变CAR T细胞分化,避免功能障碍,促进向CD8+ T细胞记忆和效应态的多能转变,并促进 CD4+细胞增殖状态。转录因子通路的探测表明,IL-9介导的STAT1和STAT4激活可能促成IL-9 信号传递CAR T细胞的优良表型,为靶向实体癌提供了有前景的治疗策略。

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